移民设计院由始建于2001年的山东省水利勘测设计院移民环评室发展而来，主要从事水利工程征地移民规划设计、社会稳定风险分析、土地复垦与后评价等业务，下设移民规划室、移民设计室、移民评估室三个内设机构。
移民规划室主要负责项目建议书、可行性研究报告和初步设计报告阶段的移民安置规划设计，负责维护、优化升级移民安置规划设计信息化平台等工作；移民设计室主要负责技施阶段移民安置规划设计和综合设代服务，负责实施管理单位的移民咨询服务，负责临时用地复垦、防护工程规划设计等工作；移民评估室主要负责大中型水库移民后期扶持规划设计和后评价（移民监督评估），负责社会稳定风险评估分析报告编制等工作。
移民设计院注重质量守正、技术创新，深耕水利水电工程移民规划设计业务。自2001年以来，先后完成了南水北调东线一期山东段工程、胶东调水、东调南下、黄水东调等调水工程，庄里、南寨、泊于、金水河、双堠、东湖、双王城、大屯、张官屯、辛集洼、博兴等水库工程，小清河防洪综合治理、沭河上游堤防治理等河道治理工程为代表的一系列具有国内重要影响力的大中型水利工程移民安置规划设计，打造了一批高质量的设计精品。同时，在大中型水库移民后期扶持规划、监测评估、社会稳定风险评估、土地复垦等业务领域取得显著成绩，项目遍布省内和西藏、贵州、安徽等多个省区。
移民设计院在工程实践中造就了一支素质优良、结构合理的人才队伍，现有员工17人，其中硕士研究生以上学历11人，高级工程师以上职称7人，河海大学基地硕士研究生导师4人，各类注册工程师6人次。
移民设计院在跨流域调水、新建水库、河道治理等水利工程征地移民规划设计方面具有行业领先的技术优势，先后荣获全国优秀水利水电工程勘测设计奖1项，山东省优秀工程勘察设计奖4项，山东省工程咨询奖1项、山东省水利科学技术进步奖3项，山东省水利工程勘测设计奖2项，山东省水利软科学优秀成果奖25项，齐鲁水利科学技术奖1项，专著2部，主编、参编著作5部，发表技术论文20余篇；自主建成智慧移民数字化管理系统平台，实现征地移民信息规范化、规划设计功能模块化高质量发展，将水库移民工作融入数字孪生工程建设；在水利水电工程移民设计领域具有卓越的技术能力和设计水平。
新时期，移民设计院将深入学习贯彻党的二十大精神，以“用情移民 用心设计”党建品牌建设为引领，以创新为动力、以需求为导向，着力打造国内一流的智能化、数字化、模块化、精细化的移民专业品牌，为中国式现代化的山东实践贡献移民设计力量。
