2019年11月18日，李克强总理主持召开南水北调东线后续工程工作会议，就加快东线二期工程建设等事项安排部署。根据国务院部署要求，水利部要求南水北调东线二期工程规划、可研、初设同步推进，2020年5月底前完成规划批复；2020年总体可研报告编制完成并批复，部分工程具备开工条件。
为尽快启动东线二期工程前期工作，12月3日，水利部淮委、海委同时召开南水北调东线二期工程前期工作推进会；省水利厅发规处、南水北调处及我院参加了相关会议。高峰院长、赵培青副总赶赴安徽蚌埠参加了淮委组织的东线二期前期工作推进会；曹先玉副院长、张贵民前往天津参加海委组织的推进会；相关南水北调东线涉及的江苏省、安徽省、河北省、天津市、北京市等也参加了会议。推进会上学习了李克强总理的讲话精神，传达了水利部就南水北调东线二期工程规划、可研、初步设计等工作部署，并就东线二期工程前期工作任务进行了初步分工。各相关省市就南水北调东线二期工程存在的问题与建议发表了意见和建议，对分工情况进行讨论；我院就二期工程与我省有关问题及任务分工提出了意见和建议。
本次水利部安排部署的南水北调东线二期工程前期工作主要是南北输水干线工程，按照事权划分由国家承担建设。目前我省境内南北干线规划方案：黄河以南在一期工程基础上进行扩建，包括扩建韩庄运河、老运河及三级泵站输水至南四湖下级湖，扩建二级坝泵站入上级湖，扩建梁济运河、柳长河及三级泵站输水入东平湖；扩建穿黄隧洞过黄河。黄河以北除了延长一期鲁北段调水时间外，扩建部分小运河后，新辟位山至临清段输水渠道，主要向京津冀地区调水。我省境内胶东输水干线、新辟黄河三角洲线路等尚未列入国家干线工程。
根据目前确定的任务分工，我院承担东线二期南水北调干线中的部分线路前期工作，主要包括：韩庄运河段万年闸泵站扩建工程、南四湖至东平湖段扩建工程（其中八里湾泵站由中水淮河规划设计研究有限公司承担）、南四湖上级湖扩挖疏浚及影响处理工程；鲁北段承担一期提升改造工程，配合中水北方勘测设计研究有限责任公司参与工程方案比选等。
